摘要：DNA甲基化作为表观遗传的一种表现形式,在植物的生长发育、抗逆和抗病过程中发挥重要作用。前期研究中从杜仲体内分离筛选到一株拮抗内生芽孢杆菌DZSY21,其可在玉米中定殖,定殖后明显增强玉米抗病性。为明确内生菌DZSY21在玉米中定殖与其DNA甲基化水平的关系,该试验利用甲基敏感扩增多态性分析技术(MSAP)和全基因组DNA甲基化(WGBS)分别对内生菌DZSY21处理的玉米基因组进行DNA甲基化水平的定性和定量研究。定性和定量结果均表明拮抗菌DZSY21引入玉米植株,可引起玉米基因组DNA总甲基化水平降低;全基因组DNA甲基化(WGBS)定量测序结果显示玉米基因组DNA总甲基化水平降低了0.89%,DNA甲基化差异性区域数据库中共有5820个差异性甲基化区域(DMRs),且GO聚类分析和Pathway功能显著性富集分析结果显示DMR相关的基因主要涉及糖代谢、氨基酸合成以及蛋白激酶活性等与抗病相关的主要功能。该结果为深入研究DNA甲基化在内生菌DZSY21定殖增强玉米抗病性中的调控机制提供理论基础。