采用GBS-seq技术构建甜瓜高密度遗传图谱

摘要:【目的】构建甜瓜高密度遗传图谱,为研究甜瓜重要性状基因定位及功能分析奠定基础。【方法】以甜瓜材料K7-4(高抗霜霉病)和K7-2(高感霜霉病)为亲本,杂交再自交得到F 2分离群体。构建GBS文库并进行双末端测序,使用滑动窗口的方法进行基因型分型,SAM TOOLS软件检测SNP位点,采用Joinmap 4.0软件进行排图,用perl SVG模块绘制连锁图,用win QTL cart 2.5进行QTL检验,根据复合区间作图法,使用R/qtl软件包进行QTL定位。【结果】构建了总长为4823.55 cM的遗传图谱,标记间平均遗传距离为1.43 cM。在苗期、生长中期和生长后期共检测到26个与甜瓜霜霉病性状相关的QTL。【结论】基于GBS-seq技术获得了甜瓜高密度遗传图谱,最终将抗霜霉病基因关联到CM3.5.1_scaffold00005上的6,831,227~7,830,935 bp,约1Mb的区间范围内。

关键词:
  • 甜瓜  
  • gbs  
  • 遗传图谱  
  • 霜霉病  
  • qtl  
作者:
张学军; 杨文莉; 张永兵; 张健; 郭丽霞; 杨永; 李寐华; 伊鸿平
单位:
新疆农业科学院哈密瓜研究中心; 乌鲁木齐830091; 衢州新农都院士工作站; 浙江衢州324022
刊名:
新疆农业科学

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期刊名称:新疆农业科学

新疆农业科学紧跟学术前沿,紧贴读者,国内刊号为:65-1097/S。坚持指导性与实用性相结合的原则,创办于1958年,杂志在全国同类期刊中发行数量名列前茅。