基于转录组学筛选miR-125b-2敲除小鼠睾丸发育相关基因及信号通路的研究

摘要:旨在研究miR-125b-2对动物精子发生和成熟的调节作用,挖掘与miR-125b-2有密切靶向关系的功能基因及信号通路。本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,构建了miR-125b-2基因敲除小鼠模型。将3只野生型(WT)小鼠和3只miR-125b-2敲除型(KO)小鼠睾丸的总RNA样分别制成样品池,采用Illumina HiSeq TM 4000平台进行转录组测序(RNA-seq),将组装得到的Unigene序列注释到Nr和KEGG数据库中注释,并进行睾丸差异表达基因(DEGs)聚类分析。结果显示,在WT和KO组睾丸组织中共筛选出324个DEGs,其中被GO注释的180个DEGs显著富集到80个包括精子染色质缩合在内的生物学过程,22个含有线粒体内膜预序列转位酶复合物在内的细胞组成以及41个包括核糖体结构组成在内的分子功能。同时KEGG分析显示,所有被注释的DEGs显著富集到74条信号通路,其中排前3位极显著的信号通路依次为:RNA转运、信使RNA监视通路和合硒化合物新陈代谢。综上表明,敲除miR-125b-2主要影响睾丸中与精子染色质结构和线粒体功能相关基因的表达,其中与精子发生相关的3个基因Papolb、Tssk 1和Slc 22a14表达均显著上调。结果为进一步研究miR-125b-2对精子生成的功能调节提供基础。

关键词:
  • 转录组学  
  • 睾丸发育  
  • 精子发生  
  • 线粒体  
作者:
李龙龙; 朱燕玲; 曾斌; 何家建; 孙加节; 陈婷; 罗君谊; 张永亮; 习欠云
单位:
华南农业大学动物科学学院; 国家生猪种业工程技术研究中心; 广东省动物营养调控重点实验室; 广州510642
刊名:
畜牧兽医学报

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期刊名称:畜牧兽医学报

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