雨生红球藻UVR8的基因克隆和生物信息学分析

摘要:【目的】获得雨生红球藻中紫外抗性蛋白(Uvresistance locus 8,UVR8)的cDNA序列全长,并进行生物信息分析。【方法】以雨生红球藻为研究对象,通过同源克隆方法获得紫外抗性蛋白UVR8的cDNA序列全长,并通过生物信息手段对其理化性质、蛋白结构及系统进化进行分析。【结果】序列分析表明,HaeUVR8的编码区全长为1554 bp,共编码517个氨基酸,预测理论等电点为5.56,理论分子量为54.31 kD。通过BLASTp分析,与拟南芥中UVR8的相似性达到51%,与莱菌衣藻中UVR8的相似性达到59%。通过蛋白保守结构域分析,HaeUVR8蛋白中存在UVR8蛋白的典型结构域,包括7个叶片螺旋结构和保守的色氨酸残基。系统进化分析表明,高等植物和真核绿藻来源UVR8s有共同祖先。【结论】本研究首次获得雨生红球藻中编码UVR8的基因序列,发现其结构与高等植物UVR8相似,暗示二者可能有相似的作用机制,为雨生红球藻中UVR8的表达、功能研究奠定基础,同时为解析雨生红球藻适应紫外光的分子机制提供线索。

关键词:
  • 紫外抗性蛋白  
  • cdna全长  
  • 结构域  
  • 系统进化  
  • 雨生红球藻  
作者:
张宏江; 抗伟; 马浩天; 王晓丹; 李润植; 崔红利
单位:
山西农业大学分子农业与生物能源研究所; 山西太谷030801
刊名:
西南农业学报

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期刊名称:西南农业学报

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