插入序列IS6100介导DNA序列转移的机制研究

摘要:目的插入序列IS6100与耐药基因转移密切相关,本研究旨在初步探究IS6100转移DNA序列的机制。方法以Genbank库中已有序列中含两个及两个以上拷贝IS6100序列的质粒或者染色体为研究对象,通过生物信息分析的方法分析各IS6100侧翼的靶位点重复序列(TSD),推测该元件转座酶可能的工作机制。结果共检索到22条序列,含5条染色体、16条质粒以及1条定位未知的转座子序列。其中有13条序列(59%)来自鞘脂菌属细菌,余下均来自条件致病菌的染色体或质粒。在鞘脂菌属细菌TKS中,IS6100拷贝数可多达29个,且IS6100和鞘脂菌属细菌基因组的GC%均接近60%。共有35条不同的8bpTSD在这些菌株中出现的频率为2~8次。TSD的GC%含量在13%~100%,有87%(30/35)的TSD序列GC%含量均≥50%。这些TSD可同时出现在同一菌株的染色体或质粒内部、同一菌株的染色体和质粒之间、不同菌株的染色体和质粒间。结论IS6100的产生菌可能为鞘脂菌属细菌。IS6100的作用靶位点没有高度选择性,但仍倾向作用于高GC%含量位点。两个IS6100可以形成复合转座子,转移其间的DNA序列,这些转座事件可以发生在分子间和分子内。

关键词:
  • dna转座子  
  • 基因转移  
  • 水平  
  • is6100  
  • 耐药机制  
作者:
聂璐; 吴奎海; 陈文静; 李炜煊
单位:
佛山市第一人民医院检验科; 广东528000
刊名:
中国医药生物技术

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期刊名称:中国医药生物技术

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