一、科技期刊本身存在的问题

1．质量问题

质量，是科技期刊发展的根本。衡量传统纸质版科技期刊的质量标准，主要是期刊本身的排版、印刷、装订质量(硬件质量)，以及期刊论文的质量(软件质量)。这两个方面的质量，共同决定着科技期刊的影响力和期刊的声誉，并最终影响着科技期刊的竞争力。纸质版的科技期刊从收稿到发行，需要经历审稿、校稿、排版、印刷、包装和发行等一系列程序，尽管存在时滞问题，但质量问题似乎更好控制。科技期刊实现网络化发行后，周期更快，加上网络版期刊容量更大，论文在收稿后较短时间内就可以实现上网发行，因而质量问题更加难以控制，导致在学术评价和职称评定中认可度不高，也就难以吸收到高质量的论文。

2．文件格式问题

文件格式是由编辑论文的计算机软件确定的。由于国内并没有针对科技期刊网络化发行而制定统一的标准，目前的主要文件格式包括PDF、ASCII、HTML、SGML、Latex、Postscript等类型。文件格式的多样化，客观上要求读者安装多种阅读软件，才能查阅各种格式的期刊论文，可能会使部分读者感觉难以适应。

3．期刊定价问题

对于出版商和订购者，价格问题是最敏感、最复杂、最令人困惑的问题。从出版商方面来讲，目的是设法降低由于纸质期刊订购量减少而带来的收入损失;从订购者方面来讲，目的是设法通过网络期刊来降低采购成本、管理成本，从而降低信息收集成本。从我国科技期刊网络化的实践来看，目前的网络期刊定价方式比较单一，并没有形成针对不同用户、不同使用方式的灵活定价机制，抑制了不同规模、不同类型的图书情报机构之间的自由竞争。

4．过刊保存问题

图书馆在订阅印刷本期刊后，只要善加保存典藏，就可以永久使用。但传统的过刊保存方式涉及到介质的自然消耗和损耗，以及人力、物力、财力投入的配套。科技期刊实现网络化发行以后，情报机构的信息提供是以有效期限为条件的，情报的索取者只能在有效期限内取用。尽管情报提供机构承诺永久保存资源，但服务提供商也可能因故停业、并购、重组等，这就涉及到过刊资源的持续供给问题。

5．期刊版本问题

与传统的印刷科技期刊一旦发行后就不能再做任何改动不同，科技期刊实现网络化发行后，只要取得适当的软件，就可以对其加以重新编辑，这虽然强化了编、读之间的互动交流，但也容易遭受到非法修改，甚至是黑客入侵，从而加大了网络化期刊的版本管理难度。

二、外部环境的问题

1．知识产权保护问题

计算机技术的发展，互联网的出现打破了传统的信息获取方式，轻而易举的复制、套录技术带来了大规模的侵权事件和知识产权纠纷。忽视作者的权利，不利于科技文化的繁荣发展;过分尊重作者的权利，又会影响科技成果的传播。因此，解决好科技期刊在网络化过程中的知识产权问题极为重要。目前，知识产权保护问题集中体现在三个方面:网络期刊复制行为没有得到有效规范，作品知识产权保护不力;期刊论文未经作者授权而被任意转载的现象较为普遍;期刊作品的引用也不规范(如一篇作品被引用时，是标注论文网址，还是标注源期刊，目前尚无统一的标准)。

2．技术问题

网络化期刊的出现是现代信息技术发展的结果。在科技期刊网络化出版过程中，最重要的技术就是信息数字化技术，它依靠计算机技术把一定形式的信息(如文字、数值、图像、声音等)转换成二进制数字编码，并对其进行组织、处理、加工、存储，采用数字传输技术加以传送，并在需要时把这些数字化的信息再还原成文字、数值、图像、声音。目前亟待解决的主要技术问题包括信息存贮、压缩、编码技术;相关软件开发技术;信息传输速度及检索技术;过刊管理技术;声像分辨技术;期刊出版格式管理技术等。

3．信息安全问题

科技期刊网络化面临的威胁主要包括黑客入侵、内部攻击、病毒入侵、信息污染、信息泄密等。由于网络信息的可复制性、可修改性、可重用性和易获得性，科技期刊的网上销售、发行、订购、付款等，都涉及到网络信息的使用。因此，科技期刊网络化对网络安全问题十分敏感，对网络安全问题提出了较高的技术要求。

4．观念和习惯问题

长期以来，人类与纸质文献相伴随，已经形成了一些阅读纸质文献的方法和根深蒂固的观念、习惯。纸质期刊有其本身的优点，如携带方便、可随时随地反复阅读、阅读时可圈点评论，从而给人一种实在的感觉。科技期刊网络化后，阅读作品必须借助计算机设备，涉及到付费问题，且长时间使用电脑会影响视力等，这些都让读者在观念和习惯上产生难以适应之感。

5．网络传输速度及收费问题

受网络设施及技术水平的约束，国内网速有限，特别是下载文献速度亟待提高，这是制约我国科技期刊网络化发展的重要“瓶颈”之一。同时，缺乏方便快捷的付款途径，以及费用相对高昂等，也是影响我国科技期刊网络化发展的重要原因之一。